- 第１話「囚人ハウス」 TWENTY VICODIN
- カディの家に車で突っ込み国外逃亡していたハウスは、12ヵ月間服役することになるが、模範的な態度により刑期が８ヵ月に短縮されることに。５日後に仮出所を控えたハウスは、収監者ニックに肘と膝の痛みを訴えられるが相手にしない。だが、診療所の女医アダムズの診断を偶然耳にしたハウスは異論を差し挟み、ニックの体を調べる。一方、刑務所を牛耳る男にハウスは、自身に処方されているバイコディンを毎日１錠上納していたが、仮釈放までに20錠用意しろと脅される。
- 第２話「仮釈放」 TRANSPLANT
- カディが病院を去り、新たに院長に就任したフォアマンは、移植用に摘出された肺を12時間以内に治療するという難しい案件のためにハウスを出所させる。ハウスのオフィスは奪われ元部下たちも病院を去っていたが、脳神経外科でボスを殴ったアジア系の新人パクと診断に取りかかる。ドナーは18歳の大学生で、オールナイトでポーカーをした後、バイク事故に遭い心肺停止。ウィルソンの患者に肺を移植しようとしたところ異変が生じた。ハウスはコカインを疑い自宅を調べる。
- 第３話「金持ちな患者」 CHARITY CASE
- ある財団に100万ドルの寄付をしたベンジャミンは、直後に道端で倒れる。診断チームを立て直すために予算が必要なハウスは、寄付目当てに診断を引き受け、刑務所での仕事を解雇されたアダムズを呼び、ボランティアで診断に協力させる。ベンジャミンが、家族に愛想をつかされても苦しい人たちを助けるのは義務だとする極端に利他的な行動を、パクは病気の症状と見なすが、状態が安定しているため、フォアマンは退院を命じる。しかしその矢先に頻脈を起こし、診断をやり直すことに。
- 第４話「CEOの決断」 RISKY BUSINESS
- 代々続く家業のCEOであるサドは、経費削減のために国内事業の中国移転を予定しているが、娘は何千人もの従業員が職を失うことになるため猛反対。そんな中、サドは周りのものが小さく見える視覚異常が現れ入院する。ハウスたちは甲状腺中毒症だとの診断を下すが、今まで小さく見えていたものが今度は大きく見えるため不思議の国のアリス症候群（小視症）と考える。一方、ハウスは元上司との間のセクハラ疑惑事件で審問会を控えるパクと、クビになるか否かで賭けをすることに。
- 第５話「告白」 THE CONFESSION
- シーダービルで唯一のガソリンスタンドを営むボブ。町長から地域社会貢献賞を贈られた夜、ミス・シーダービルのシンディとモーテルでセックス中に心臓発作を起こす。チェイスとタウブが復帰した診断チームは、ボブがけいれん発作を起こしたため光過敏性てんかんを疑い検査で確かめることに。当初ボブは浮気を妻に隠していたが、罪悪感に苛まれて妻に告白し、さらに町民たちにもこれまでの罪を告白し始める。一方、ハウスはタウブの２人の娘の出自を怪しみDNA鑑定を主張する。
- 第６話「倒れたピエロ」 PARENTS
- 亡き父に憧れてピエロを目指すベンは、ある誕生会で子供に股を殴られ手足が動かなくなる。母親と再婚相手はベンの進路に反対していたが、親となったタウブがベンの肩を持ち、チーム内で子育て議論が巻き起こる。ベンの診断は難航し、やがて鼻と口から出血したことからチームは再生不良性貧血を疑う。一方、ウィルソンが、家でハウスと観る約束をしていたボクシングの試合のチケットを手に入れる。ハウスは仮釈放中で監視装置付きのため会場に行けないが、根回しをすると言う。
- 第７話「おせっかい診断」 DEAD AND BURIED
- フォアマンから指示された、14歳の誕生会で間欠性発作を起こしたアイリスの診断を部下たちに任せたハウスは、セラピーで出会った男の息子の真の死因を独自に調べる。４歳で腎不全を患いベルジェ病で死亡したとされる少年の墓地を訪れ、さらには少年が住んでいた家にも行ったハウスは、フォアマンやウィルソンに勝手な行動を注意されるが聞く耳を持たない。一方、アイリスには次々と別の症状が現れ、下腹部と胸の痛みを訴え生理も不順なため、チームは妊娠を疑う。
- 第８話「危ない妄想」 PERILS OF PARANOIA
- 検察官トミーが、裁判中に発作を起こして病院へ運ばれる。一通り検査を行うが、ハウスは妻が毒を盛ったと考えてアダムズとパクに自宅を調査させる。すると大量の銃を保管した隠し部屋が見つかり、トミーは政府が崩壊した時のために妻に内緒で隠し持っていたと主張。アダムズは妄想症だと考えるが、コカイン使用、ファール病などが候補に上がり、全てを検査することに。一方、仕事漬けのフォアマンはタウブに恋人が必要だとアドバイスされ、ある女性と親密になるが…。
- 第９話「よき伴侶」 BETTER HALF
- 妻ナタリーに連れられて、若年性アルツハイマーのアンドレアスは病院へ。進行状況を確認中に血を吐き、嘔吐したためチームが診断することになる。タウブが休暇中のためフォアマンが協力するが、ハウスはいちいち反抗的な態度をとる。チームはアンドレアスに胃カメラの検査をするが、再び嘔吐し、彼が献身的に看病する妻の顔面を殴るのを目撃する。一方、ウィルソンが、外来の患者が性的関係に一切興味がない無性愛者だと話すと、ハウスは反論し100ドルを賭けて原因を突き止めることに。
- 第10話「家出少女」 RUNAWAYS
- 18歳のキャリーが父親と共に外来診療を訪れ呼吸障害を訴えるが、ハウスは親子を偽ったホームレスだと見抜く。キャリーは逃げようとするが耳から出血し、入院することに。アダムズは彼女が未成年だと考え、ソーシャルワーカーに連絡すべきだと主張するが、ハウスは診断を続ける。学校にも通い成績優秀なキャリーは、なぜホームレスなのか？ やがて母親が現れるが、キャリー は拒絶し病状は悪化する。一方で、ハウスは南北戦争時代の南軍の軍服を着て兵士になりきる兄弟を診察する。
- 第11話「責任問題」 NOBODY'S FAULT
- フォアマンは、かつての恩師でマーシー病院の神経内科長コフィールドに、患者が暴れてチェイスの胸にメスを刺し、重傷を負った事件に関する懲罰審問を依頼する。停職処分になれば仮釈放が取り消されてしまうハウスは、他のメンバーと共に個別で事情聴取を受ける。高校の化学教師ビルがジョギング中に意識を失い、四肢麻痺を引き起こして入院してきたことが、ことの始まり。ハウスは化学実験中の爆発が原因だと考えて診断を進めるが、アダムズの意見に同意したチェイスは…。
- 第12話「刺されたチェイス」 CHASE
- 患者にメスで刺されて一時は脚が麻痺するが、一命を取り留めたチェイスは３週間仕事を休み、女性との快楽にふけっていた。ハウスに復帰時期を聞かれ、わからないと答えるものの、リハビリをしに病院へ来た際に、フォアマンから、ハウスのもとへ戻らなくてもよいが外来診療の借りが20時間あると言われて渋々診療へ。左肩の痛みを訴える修道女を志願するモイラを診察すると、胸に小さいしこりがあるため入院させることに。検査を続ける中で、チェイスはモイラと心が通じ合うが…。